Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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