Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms