Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNB1P11230 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNB1P11230 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHRNB1P11230 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms