Protein–RNA interactions for Protein: P09497

CLTB, Clathrin light chain B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTBP09497 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLTBP09497 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLTBP09497 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLTBP09497 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLTBP09497 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLTBP09497 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLTBP09497 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLTBP09497 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLTBP09497 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLTBP09497 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLTBP09497 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLTBP09497 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLTBP09497 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CLTBP09497 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLTBP09497 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLTBP09497 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLTBP09497 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CLTBP09497 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTBP09497 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTBP09497 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTBP09497 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTBP09497 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTBP09497 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTBP09497 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTBP09497 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTBP09497 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTBP09497 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTBP09497 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTBP09497 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTBP09497 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTBP09497 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTBP09497 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTBP09497 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTBP09497 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTBP09497 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTBP09497 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTBP09497 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTBP09497 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTBP09497 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTBP09497 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTBP09497 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTBP09497 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTBP09497 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTBP09497 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTBP09497 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTBP09497 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTBP09497 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTBP09497 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTBP09497 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTBP09497 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms