Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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PTPRCP08575 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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PTPRCP08575 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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PTPRCP08575 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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PTPRCP08575 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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