Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR5O60602 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR5O60602 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR5O60602 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR5O60602 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR5O60602 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR5O60602 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR5O60602 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR5O60602 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR5O60602 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR5O60602 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR5O60602 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR5O60602 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR5O60602 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR5O60602 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR5O60602 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR5O60602 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLR5O60602 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLR5O60602 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TLR5O60602 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms