Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms