Protein–RNA interactions for Protein: O00237

RNF103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF103O00237 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF103O00237 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF103O00237 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms