Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms