Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms