Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN6

NPIPB15, Nuclear pore complex-interacting protein family member B15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB15A6NHN6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB15A6NHN6 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms