Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms