Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF346Q9UL40 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms