Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MTRF1LQ9UGC7 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms