Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE2

CISH, Cytokine-inducible SH2-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CISHQ9NSE2 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CISHQ9NSE2 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms