Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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