Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2AFJQ9BTM1 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2AFJQ9BTM1 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms