Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 PLA2G4C-AS1-203ENST00000601950 454 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYT17Q9BSW7 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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