Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRACR2AQ9BSW2 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms