Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 HYLS1-202ENST00000425380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 AMPD2-203ENST00000358729 2838 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 CD99L2-203ENST00000370377 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 KLHL38-201ENST00000325995 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 ANKZF1-203ENST00000410034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf88Q9BSF0 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ALOXE3-201ENST00000318227 3053 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 PTGR2-205ENST00000555661 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 BLZF1-201ENST00000329281 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ELMOD3-202ENST00000393852 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 343.8 ms