Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AC078842.2-201ENST00000447529 1835 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AL512274.1-201ENST00000562471 2027 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms