Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms