Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms