Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms