Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms