Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B4

FBXO39, F-box only protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO39Q8N4B4 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FBXO39Q8N4B4 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 256.1 ms