Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SV2AQ7L0J3 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms