Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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