Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW60

PCSK4, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 4, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK4Q6UW60 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCSK4Q6UW60 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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