Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DUX4L9Q6RFH8 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
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