Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD40Q6AI12 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms