Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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