Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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