Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms