Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
NRF1Q16656 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NRF1Q16656 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms