Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGCAQ16586 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SGCAQ16586 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SGCAQ16586 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SGCAQ16586 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SGCAQ16586 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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SGCAQ16586 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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SGCAQ16586 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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SGCAQ16586 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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SGCAQ16586 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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SGCAQ16586 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SGCAQ16586 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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