Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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PDCD1Q15116 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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PDCD1Q15116 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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PDCD1Q15116 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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PDCD1Q15116 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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PDCD1Q15116 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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PDCD1Q15116 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PDCD1Q15116 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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