Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFIXQ14938 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
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