Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CBFBQ13951 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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