Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOFQ13790 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOFQ13790 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOFQ13790 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOFQ13790 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOFQ13790 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOFQ13790 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOFQ13790 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOFQ13790 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOFQ13790 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APOFQ13790 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOFQ13790 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOFQ13790 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOFQ13790 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOFQ13790 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOFQ13790 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOFQ13790 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
APOFQ13790 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOFQ13790 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOFQ13790 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOFQ13790 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOFQ13790 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOFQ13790 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOFQ13790 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOFQ13790 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
APOFQ13790 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOFQ13790 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOFQ13790 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOFQ13790 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOFQ13790 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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APOFQ13790 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
APOFQ13790 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOFQ13790 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOFQ13790 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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APOFQ13790 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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APOFQ13790 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOFQ13790 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOFQ13790 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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APOFQ13790 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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APOFQ13790 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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APOFQ13790 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
APOFQ13790 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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