Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CUL1Q13616 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CUL1Q13616 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CUL1Q13616 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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