Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM2Q13029 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
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