Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSRP1Q08945 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms