Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA3Q08378 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms