Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms