Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PSME1Q06323 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms