Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms