Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms