Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms