Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED6P86452 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms